Здравствуйте.
В соответствии с ч. 2 ст. 209 ГК РФ, собственник вправе по своему усмотрению совершать в отношении принадлежащего ему имущества любые действия, не противоречащие закону и не нарушающие права и охраняемые законом интересы других лиц.
В соответствии с ч. 2. ст. 246 ГК РФ, участник долевой собственности вправе по своему усмотрению продать свою долю с соблюдением правил ч. 2 ст. 250 ГК РФ — преимущественного права покупки, предоставляемого остальным участникам долевой собственности.
Следовательно, Вы и Ваш отец вправе продать каждый свою долю в принадлежащей вам на праве общей долевой собственности квартире по отдельным договорам купли-продажи, определив стоимость продаваемой доли.